公众号和小程序的认证是分开进行的。
首先，微信公众号需要先进行认证，才能开通微信支付功能。在公众号后台，可以选择“设置”-“开发”-“开发者模式”，然后按照提示填写相关信息并提交审核。审核通过后，公众号就可以使用微信支付功能了。
其次，微信小程序也需要进行认证。在小程序后台，可以选择“开发”-“开发者工具”，然后点击“上传代码”。在上传代码时，需要填写一个唯一的证书文件，这个证书文件就是微信小程序的认证证书。证书文件可以通过微信公众平台获取，也可以自己制作。制作证书文件需要用到一些编程知识，例如生成随机数、加密等。
最后，需要注意的是，公众号和小程序的认证是不同的。公众号的认证是由微信官方进行的，而小程序的认证是由小程序开发者自行进行的。因此，在进行认证时，需要分别提交相关材料给不同的部门。
