企业定制开发软件的主要方式有以下几种：
1. 直接开发：企业可以根据自己的需求，委托一家专业的软件开发公司进行定制开发。这种方式的优点是可以充分利用软件开发公司的技术力量和经验，快速实现企业的需求。但是，这种方式的缺点是成本较高，周期较长，且后期的维护和升级也需要支付额外的费用。
2. 购买现成软件：企业可以购买市场上已经存在的软件产品，然后进行定制开发以满足自己的特殊需求。这种方式的优点是成本低，周期短，而且可以根据企业的具体情况进行定制，提高软件的适用性。但是，这种方式的缺点是无法完全满足企业的需求，可能需要进行大量的修改和调整。
3. 合作开发：企业可以与软件开发公司或者高校、研究机构等进行合作，共同开发一款适合自己需求的软件。这种方式的优点是可以充分发挥各方的优势，提高软件的开发效率和质量。但是，这种方式的缺点是需要投入大量的人力和物力，且合作双方需要有共同的目标和利益。
4. 外包开发：企业可以将软件开发的部分任务外包给专业的软件开发公司。这种方式的优点是可以利用外部的专业力量，提高软件的开发效率和质量。但是，这种方式的缺点是成本较高，且后期的维护和升级也需要支付额外的费用。
5. 自主开发：企业可以组建一支专业的软件开发团队，自行进行软件开发。这种方式的优点是可以实现完全自主的控制，可以根据企业的具体情况进行定制化开发。但是，这种方式的缺点是成本较高，且开发周期较长，且后期的维护和升级也需要支付额外的费用。
总之，企业定制开发软件的方式多种多样，企业需要根据自身的实际情况和需求，选择最适合自己的方式。
