净化车间系统开发票的大类科目主要包括以下几种：
1. 技术服务费：这是净化车间系统开发的主要费用，包括开发人员的工资、办公费用、设备折旧等。
2. 材料费：这是指开发过程中使用的各种原材料和辅助材料的采购费用，如电子设备、软件、办公用品等。
3. 差旅费：如果开发人员需要出差，那么差旅费也需要计入发票中。
4. 培训费：如果开发过程中需要进行人员培训，那么培训费也需要计入发票中。
5. 咨询费：如果开发过程中需要咨询专业人士的意见，那么咨询费也需要计入发票中。
6. 租赁费：如果开发过程中需要租赁办公场所或者设备，那么租赁费也需要计入发票中。
7. 维护费：如果开发过程中需要维护设备或者网络，那么维护费也需要计入发票中。
8. 其他费用：这是指在上述大类科目之外，根据具体情况产生的其他费用，如电费、水费、税费等。
在开具发票时，需要根据实际发生的费用进行填写，确保发票的准确性和完整性。同时，还需要按照国家税收政策的规定，合理计算税额，确保税务合规。
