软件企业认定手续流程通常包括以下几个步骤：
1. 申请报告：首先，企业需要准备一份详尽的申请报告，报告中应包括企业的基本信息、软件开发和运营情况、人员结构、财务状况等。
2. 提交材料：将申请报告和其他相关材料提交给相关部门，如工业和信息化部、财政部等。这些材料可能包括营业执照、税务登记证、财务报表、人员资质证明等。
3. 审核过程：相关部门会对提交的材料进行审核，主要看企业的软件产品是否具有自主知识产权，研发能力如何，以及是否存在违法违规行为等。
4. 现场检查：如果审核通过，相关部门可能会安排对企业进行现场检查，以验证企业的实际情况是否符合认定条件。
5. 公示：审核通过后，相关部门会在官方网站上公示企业信息，接受社会监督。
6. 颁发证书：公示无异议或异议已解决的企业，将颁发软件企业认定证书。
7. 定期复审：证书颁发后，企业还需要定期进行复审，以确保其持续符合认定条件。
8. 后续管理：获得认定证书的企业需要按照相关规定进行日常管理，如及时更新企业信息、遵守相关法律法规等。
在整个流程中，企业需要提供真实、准确的信息，并积极配合相关部门的审核工作。同时，企业还需要关注相关政策的变化，以便及时调整自己的经营策略。
