公司研发软件出售的会计分录需要根据具体的会计准则和税法来确定。以下是根据中国会计准则（2016年修订版）进行的一般性说明：
1. 确认收入时，按照销售商品或提供服务的准则进行会计处理。
2. 计算应纳税额，根据适用的税率计算增值税、所得税等。
3. 记录相关的成本和费用，如研发投入、生产成本、管理费用等。
4. 根据会计政策和相关法规，将收入和成本费用结转到损益表。
5. 如果涉及其他税务事项，如关税、出口退税等，也需要进行相应的会计处理。
以下是一个简化的例子，假设公司研发的软件已经投入市场并开始销售：
1. 确认销售收入：
- 借：应收账款/银行存款 xx元
- 贷：主营业务收入 xx元
- 贷：应交税费-应交增值税（销项税额）[金额 = xx元 / (1 + 税率)]
2. 计算应纳税额：
- 借：应交税费-应交增值税（销项税额）
- 贷：应交税费-应交增值税（进项税额）
- 贷：应交税费-应交所得税
3. 记录成本和费用：
- 借：主营业务成本 xx元
- 贷：研发支出 xx元
- 贷：银行存款/现金 xx元
4. 结转损益：
- 借：主营业务利润 xx元
- 贷：本年利润 xx元
5. 如果涉及其他税务事项：
- 借：应交税费-应交增值税（进项税额转出）
- 贷：应交税费-应交增值税（销项税额转出）
- 贷：应交税费-应交所得税
请注意，这只是一个简化的例子，实际的会计分录可能会更复杂，取决于公司的具体情况和适用的会计准则。在实际操作中，建议咨询专业的会计师或税务顾问以确保正确无误。
