软件企业三免两减半备案资料主要包括以下几类：
1. 营业执照复印件：提供企业的营业执照复印件，证明企业合法经营。
2. 税务登记证复印件：提供企业的税务登记证复印件，证明企业已按规定缴纳税款。
3. 组织机构代码证复印件：提供企业的组织机构代码证复印件，证明企业具有合法的组织机构代码。
4. 法定代表人身份证明：提供法定代表人的身份证复印件，证明法定代表人的身份和资格。
5. 软件著作权证书：提供软件著作权证书，证明软件具有自主知识产权。
6. 软件产品登记证书：提供软件产品登记证书，证明软件产品已经通过相关部门的审核和认证。
7. 软件企业认定证书：提供软件企业认定证书，证明企业在软件行业中的地位和能力。
8. 软件项目合同：提供软件项目的合同，证明企业正在进行的软件项目是合法的、有商业价值的。
9. 软件研发计划：提供软件研发计划，证明企业有明确的软件开发目标和计划。
10. 软件测试报告：提供软件测试报告，证明软件产品经过严格的测试，符合质量要求。
11. 软件知识产权保护措施：提供软件知识产权保护措施，证明企业有完善的知识产权保护机制。
12. 软件企业资质证书：提供软件企业资质证书，证明企业具备从事软件业务的基本条件。
13. 软件企业信用记录：提供软件企业的信用记录，证明企业在经营活动中遵守法律法规，具有良好的信誉。
14. 软件企业财务报表：提供软件企业的财务报表，证明企业在经营活动中有良好的财务状况。
15. 其他相关证明材料：根据具体情况，可能还需要提供其他相关证明材料，如软件产品的市场分析报告、软件产品的用户反馈等。
在准备这些备案资料时，企业需要确保所有文件的真实性、合法性和有效性，以免影响备案进程。同时，企业还需要关注相关政策的变化，及时更新备案资料。
