在财务软件中，做账时计入成本费用的科目主要包括以下几种：
1. 主营业务成本：这是企业销售产品或提供服务所发生的直接成本，包括原材料、人工、制造费用等。在财务软件中，可以通过输入产品的销售价格、数量等信息来计算主营业务成本。
2. 管理费用：这是企业日常运营过程中发生的间接成本，包括办公费、水电费、差旅费等。在财务软件中，可以通过输入办公用品的采购价格、水电费用等来计算管理费用。
3. 销售费用：这是企业销售产品或提供服务过程中发生的费用，包括广告费、推广费、运输费等。在财务软件中，可以通过输入广告费用、运输费用等来计算销售费用。
4. 财务费用：这是企业在财务管理过程中发生的费用，包括利息支出、汇兑损失等。在财务软件中，可以通过输入借款利息、汇率变动等来计算财务费用。
5. 研发费用：这是企业为了开发新产品或改进现有产品而发生的费用，包括研发投入、实验费用等。在财务软件中，可以通过输入研发项目的预算、实际支出等来计算研发费用。
6. 其他费用：这是指除上述科目外的其他费用，如罚款、违约金等。在财务软件中，可以通过输入罚款金额、违约金金额等来计算其他费用。
在财务软件中，通常需要设置多个科目来记录不同类型和来源的成本费用。例如，可以设置“主营业务成本”、“管理费用”、“销售费用”、“财务费用”等科目，分别对应不同的成本费用类别。同时，还需要根据企业的具体情况，为每个科目设置相应的计算公式，以便在录入数据时自动计算成本费用。
此外，财务软件还可以提供一些辅助功能，如自动生成财务报表、生成成本分析报表等，帮助企业更有效地管理和控制成本费用。通过这些功能，企业可以更好地了解自身的财务状况，为决策提供有力支持。
