在会计处理中，公司POS机刷卡扣除手续费通常涉及以下几个步骤：
1. 确认交易金额：首先，需要确认通过POS机刷卡的金额。这可以通过查看交易记录或与银行对账来完成。
2. 确认手续费率：接下来，需要确定手续费的费率。这通常是由银行或支付平台规定的，并会在交易时自动计算。
3. 计算手续费：根据确定的费率，可以计算出应扣除的手续费总额。例如，如果手续费率为0.5%，那么应扣除的手续费为交易金额的0.5%。
4. 记录借方和贷方分录：为了反映这笔交易的影响，需要在会计分录中记录借方和贷方。
借方分录（表示费用的发生）：
```
借：销售费用/管理费用/其他相关费用账户
贷：应收账款/应付账款/其他相关资产账户
```
贷方分录（表示收入的增加）：
```
借：应收账款/应付账款/其他相关资产账户
贷：主营业务收入/其他业务收入账户
```
在这个分录中，“销售费用”或“管理费用”是借方科目，表示因交易产生的费用；而“应收账款”、“应付账款”或其他相关资产科目是贷方科目，表示因交易增加的收入。
5. 更新财务报表：最后，需要将这个分录添加到公司的财务报表中，以反映实际的交易情况。
请注意，具体的会计分录可能会根据公司的具体政策、会计准则以及适用的税法有所不同。在进行实际操作时，建议咨询专业的会计师或财务顾问以确保正确无误。
