在软件研发费开票免税的情况下，企业需要遵循一定的程序和规定来开具发票。以下是一些步骤和注意事项：
1. 了解政策：首先，企业需要了解国家和地方关于软件研发费开票免税的具体政策。这可能包括税率、免税额度、申报流程等。
2. 确定免税资格：企业需要确保自己符合免税资格。这通常要求企业具有一定的规模、研发能力或者与国家重点项目有关联。
3. 准备相关材料：企业需要准备以下材料：
- 营业执照复印件
- 税务登记证复印件
- 组织机构代码证复印件
- 增值税一般纳税人资格证书（如有）
- 软件研发合同或协议
- 研发费用明细表
- 其他可能需要的证明文件
4. 提交申请：企业将准备好的材料提交给当地的税务局，并填写相关的免税申请表。
5. 审核与确认：税务局会对企业的申请进行审核，确认是否符合免税条件。如果符合条件，税务局会出具相应的免税证明。
6. 开具发票：在获得免税证明后，企业可以按照正常的流程开具发票。这通常包括填写发票抬头、税号、税率等信息。
7. 保存记录：企业需要妥善保存所有与软件研发费开票免税相关的文件和记录，以备后续查询和审计。
8. 注意时效性：请注意，免税政策可能会有时效性，企业需要密切关注相关政策的变化，以免错过免税期。
9. 咨询专业意见：如有疑问，企业可以咨询专业的税务顾问或会计师，以确保按照规定的程序和规定来操作。
总之，软件研发费开票免税是一项复杂的工作，需要企业充分了解政策、准备相关材料、提交申请、审核确认、开具发票等步骤。同时，企业还需要关注政策的时效性和自身的合规性。通过以上步骤，企业可以确保顺利享受到软件研发费开票免税的优惠。
