大数据政府审计的难点主要包括以下几个方面：
1. 数据质量与完整性：大数据环境下，数据来源多样、格式不一，且可能存在缺失值、错误值等问题。这给审计人员带来了较大的挑战，需要对海量数据进行清洗、筛选和验证，以确保数据的准确性和完整性。
2. 数据处理与分析能力：大数据技术涉及数据采集、存储、处理、分析和可视化等多个环节，审计人员需要具备一定的数据处理和分析能力，以便从海量数据中提取有价值的信息，为审计决策提供支持。
3. 审计工具与方法：传统的审计工具和方法在面对大数据环境下的复杂问题时，可能显得力不从心。因此，审计人员需要不断探索新的审计工具和方法，以提高审计效率和准确性。
4. 法规与政策限制：大数据政府审计涉及多个领域的法律法规和政策要求，如隐私保护、信息安全等。审计人员需要熟悉相关法律法规，确保审计工作的合法性和合规性。
5. 跨部门协作与沟通：大数据政府审计涉及多个政府部门和机构，审计人员需要与其他部门密切合作，共同开展审计工作。然而，不同部门之间的沟通协调可能存在困难，影响审计工作的顺利进行。
6. 审计结果的应用与反馈：大数据政府审计的结果需要及时反馈给相关部门，以便他们根据审计建议进行调整和改进。然而，审计结果的传递和反馈过程可能存在延迟，影响审计效果的发挥。
7. 审计人员素质与能力：大数据政府审计对审计人员的综合素质和能力提出了更高的要求。审计人员需要具备较强的数据分析、逻辑思维、沟通能力等，以应对大数据环境下的复杂问题。
8. 审计资源与投入：大数据政府审计需要投入大量的人力、物力和财力资源。然而，由于审计任务繁重、周期较长等因素，审计资源的投入可能受到限制，影响审计工作的开展。
9. 审计风险与保密性：大数据环境下，审计对象的信息可能被泄露或滥用，导致审计风险增加。同时，审计过程中涉及敏感信息的收集和分析，需要严格遵循保密原则，确保审计工作的顺利进行。
10. 审计标准与评价体系：大数据政府审计涉及多个领域和行业，审计标准和评价体系需要不断完善和发展。目前，我国尚未建立完善的大数据政府审计标准和评价体系，这给审计人员的工作带来了一定的困难。
