水环境监测系统建设机制工作程序主要包括以下几个方面：
1. 制定规划：首先，需要制定一个详细的水环境监测系统建设规划，包括监测点位的设置、监测设备的选型、监测数据的处理和分析等。这个规划应该考虑到当地的水环境特点、监测需求和预算等因素。
2. 设备采购与安装：根据规划，购买必要的监测设备，如水质采样器、自动监测站等。然后，按照规划进行设备的安装和调试，确保设备能够正常运行。
3. 人员培训：为了确保监测数据的准确性，需要对相关人员进行培训，让他们了解监测设备的操作方法、数据处理流程等。
4. 数据收集与传输：在监测过程中，需要实时收集监测数据，并通过无线网络或有线网络将数据传输到数据中心。同时，还需要定期将数据传输回实验室进行分析和比对。
5. 数据分析与报告：通过对收集到的数据进行分析，可以得出水质变化的趋势和原因，为决策提供依据。此外，还需要定期生成监测报告，向相关部门报告水质状况。
6. 问题处理与反馈：在监测过程中，如果发现异常情况，需要及时进行处理，并向相关部门报告。同时，还需要定期对监测系统进行检查和维护，确保其正常运行。
7. 持续改进：根据监测结果和反馈，不断优化监测方案，提高监测效率和准确性。
8. 资金管理：为了保证监测系统的正常运行，需要对资金进行合理管理，确保有足够的资金支持监测工作的开展。
9. 法规遵守：在建设和管理水环境监测系统的过程中，需要严格遵守相关的法律法规，确保监测工作的合法性。
10. 合作与交流：与其他相关部门、研究机构和企业进行合作与交流，共享监测数据和研究成果，共同推动水环境监测事业的发展。
