计算机信息系统安全保护的主管部门是中华人民共和国国家互联网信息办公室（简称：国家网信办）。
国家网信办的主要职责包括制定和实施网络安全政策、法规和标准，负责网络安全审查和监管，指导和协调网络安全工作，以及处理网络安全事件等。此外，国家网信办还负责对网络内容进行管理和监督，打击网络犯罪，维护网络秩序和社会稳定。
在具体操作中，国家网信办会与多个部门和机构合作，共同应对网络安全挑战。例如，与公安部、国家安全部等部门联合开展网络安全执法行动，与工业和信息化部等部门共同推动网络安全技术研发和应用，与教育部等部门共同加强网络安全教育和培训等。
总之，国家网信办作为计算机信息系统安全保护的主管部门，承担着重要的责任和使命。通过制定政策、法规和标准，加强监管和执法，以及推动技术研发和应用等措施，为国家的网络安全提供有力保障。
