软件系统开发和应用程序开发虽然在很多情况下可以互换使用，但它们之间还是存在一些细微的差别。
1. 范围：软件系统开发通常指的是开发一个复杂的软件系统，这可能包括多个模块、组件和服务。而应用程序开发则更侧重于开发特定的功能或服务，这些功能通常是针对特定用户群体或业务需求设计的。
2. 目标：软件系统开发的目标是创建一个能够处理各种任务的复杂系统，它可以支持多种业务流程，并与其他系统集成。而应用程序开发的目标则是创建满足特定用户需求的软件产品，这些产品可能是为了解决特定的问题或提供特定的服务。
3. 技术栈：软件系统开发可能需要使用到多种编程语言、框架、工具和技术，以实现系统的可扩展性、可维护性和性能优化。而应用程序开发则通常依赖于特定的编程语言、框架或工具，以满足特定场景的需求。
4. 生命周期：软件系统开发通常涉及到整个软件开发生命周期，包括需求分析、设计、编码、测试、部署和维护等阶段。而应用程序开发则可能只涉及到其中的一部分阶段，例如编码、测试和部署。
5. 团队协作：软件系统开发可能需要多个团队协同工作，包括开发人员、设计师、测试人员和运维人员等。而应用程序开发则通常由一个或几个开发人员独立完成。
6. 可重用性：软件系统开发强调的是模块化和可重用性，以便在不同的项目中重复使用相同的组件或服务。而应用程序开发则更侧重于为特定用户群体或业务需求定制特定的功能或服务。
总之，软件系统开发和应用程序开发虽然在某些方面可以互换使用，但它们在范围、目标、技术栈、生命周期、团队协作和可重用性等方面都存在一定的差别。在选择开发项目时，需要根据具体的业务需求和目标来确定是进行软件系统开发还是应用程序开发。
