软件企业收到即征即退税款的处理方式，通常涉及以下几个步骤：
1. 确认退税金额和类型：企业需要确认收到的退税款项的具体金额以及退税的类型（如增值税、所得税等）。这通常由税务机关通过电子税务局系统自动完成。
2. 核对账务记录：企业财务部门需要核对相关的会计账目，确保退税款项已经正确入账。这包括将退税款计入应交税费科目，并调整相应的利润表或损益表。
3. 准备税务申报资料：根据国家税务总局的规定，企业需要准备相关的税务申报资料，包括但不限于税务登记证、财务报表、纳税申报表、税务检查报告等。
4. 提交税务申报：企业需要在规定的时间内向税务机关提交税务申报资料。申报内容包括退税款项的详细信息、企业的财务状况、税务合规性等。
5. 审核与反馈：税务机关会对企业的税务申报进行审核，并在审核通过后反馈审核结果。如果审核未通过，企业需要根据反馈意见修改相关资料，重新提交申报。
6. 领取退税款项：在税务机关审核通过后，企业可以领取退税款项。这通常通过银行转账或其他支付方式完成。
7. 后续管理：企业在收到退税款项后，还需要对这笔资金进行后续管理，确保其用于合法合规的用途，如研发投入、员工福利等。
8. 跟踪审计：企业应定期进行内部审计，以确保税务申报的准确性和合规性。同时，企业还应关注税务政策的变化，及时调整税务策略。
9. 培训与教育：企业应定期对员工进行税务知识和政策的培训，提高员工的税务意识和能力，确保企业在税务方面能够顺利应对各种挑战。
总之，软件企业收到即征即退税款后，需要按照国家税务总局的规定进行详细的处理，确保退税款项的正确使用，并加强税务管理和培训，以提升企业的税务合规性和竞争力。
