出纳人员操作进销存系统是否违法，需要从多个角度进行分析。以下是对这一问题的探讨：
一、法律依据
1. 《中华人民共和国会计法》：该法律规定了会计人员的职责和权限，包括负责记账、审核原始凭证、编制财务报表等。出纳人员作为会计工作的直接执行者，其操作进销存系统的行为应当符合《会计法》的规定。
2. 《中华人民共和国公司法》：该法律规定了公司的财务管理制度，包括财务报告、审计等方面的要求。出纳人员在操作进销存系统时，应当遵守公司的财务规定，确保财务数据的真实性和完整性。
3. 《中华人民共和国税收征管法》：该法律规定了纳税人的权利和义务，包括依法纳税、接受税务检查等。出纳人员在操作进销存系统时，应当遵守税收法规，确保税务信息的准确无误。
4. 《中华人民共和国合同法》：该法律规定了合同的订立、履行、变更、解除等方面的内容。出纳人员在操作进销存系统时，应当遵循合同法的原则，确保合同的合法性和有效性。
5. 《中华人民共和国反洗钱法》：该法律规定了金融机构及其工作人员在反洗钱工作中的责任和义务。出纳人员在操作进销存系统时，应当遵守反洗钱法的规定，防止洗钱行为的发生。
二、操作规范
1. 权限管理：出纳人员应当严格按照权限范围操作进销存系统，不得擅自越权操作。同时，应当及时向上级领导汇报操作情况，确保操作的合规性。
2. 数据备份与恢复：出纳人员应当定期对进销存系统进行数据备份，以防止数据丢失或损坏。在发生数据丢失或损坏时，应当及时进行数据恢复，确保业务的正常进行。
3. 系统安全：出纳人员应当采取必要的措施保护进销存系统的信息安全，防止黑客攻击、病毒感染等风险。同时，应当定期对系统进行安全检查，确保系统的安全性。
4. 业务流程控制：出纳人员应当严格按照业务流程操作进销存系统，确保业务的合规性和准确性。在遇到特殊情况时，应当及时向上级领导汇报，并按照相关规定进行处理。
5. 法律法规遵守：出纳人员在操作进销存系统时，应当严格遵守国家法律法规，不得违反相关法律法规的规定。同时，应当加强自身的法律意识，提高法律素养。
三、违规后果
1. 法律责任：出纳人员如果违反了相关法律、法规的规定，可能会承担相应的法律责任。这包括但不限于罚款、吊销营业执照、追究刑事责任等。
2. 经济损失：出纳人员如果因操作不当导致公司遭受经济损失，可能需要承担相应的赔偿责任。这包括但不限于赔偿客户损失、赔偿供应商损失等。
3. 信誉损害：出纳人员如果因操作不当导致公司声誉受损，可能会对公司的长期发展造成负面影响。这包括但不限于降低客户信任度、影响合作伙伴关系等。
4. 内部管理问题：出纳人员如果因操作不当导致内部管理混乱，可能会引发其他员工效仿，影响整个公司的运营效率。这包括但不限于降低员工士气、增加管理成本等。
5. 社会影响：出纳人员如果因操作不当导致社会舆论关注，可能会对公司的形象造成严重损害。这包括但不限于面临媒体曝光、公关危机等。
四、建议措施
1. 加强培训：企业应加强对出纳人员的培训，提高其法律意识和操作技能。通过培训，使出纳人员熟悉相关法律法规，掌握正确的操作方法，避免违规操作。
2. 完善制度：企业应建立健全的操作规范和管理制度，明确出纳人员的职责和权限，规范操作流程，确保操作的合规性和安全性。
3. 强化监督：企业应加强对出纳人员的监督和管理，建立有效的监督机制，及时发现和纠正违规操作行为，维护企业的正常运营秩序。
4. 提升意识：企业应加强员工的法治教育和职业道德教育，提高员工的法律意识和职业道德水平，使其自觉遵守法律法规和企业内部规章制度。
5. 及时沟通：企业应及时与出纳人员沟通，了解其操作情况和遇到的问题，提供必要的指导和支持，帮助其解决操作中的难题。同时，鼓励出纳人员提出意见和建议，共同推动企业的发展。
综上所述，出纳人员操作进销存系统并不违法，但必须遵守相关的法律、法规和企业内部规定。为了确保操作的合规性和安全性，出纳人员应当加强学习，提高自己的法律意识和操作技能；企业应当建立健全的操作规范和管理制度，加强对出纳人员的监督和管理；双方共同努力，确保进销存系统的正常运行和企业的健康发展。
