软件使用费计入的会计科目主要有以下几种：
1. 管理费用：这是最常见的一种方式，将软件使用费计入管理费用。这是因为软件的使用通常是为了提高企业的管理水平和运营效率，因此将其视为企业的一种投入，而非直接的生产成本。在计算企业所得税时，这部分费用可以作为可扣除的费用进行抵扣。
2. 研发费用：如果软件的使用是企业自主研发的成果，那么可以将软件使用费计入研发费用。这是因为研发费用通常包括了研发过程中的所有费用，包括原材料、人工、设备等成本，以及相关的管理费用。在这种情况下，软件使用费可以被认定为研发费用的一部分。
3. 无形资产：如果软件的使用涉及到企业的知识产权，那么可以将软件使用费计入无形资产。这是因为无形资产通常包括了企业的专利、商标、著作权等知识产权。在这种情况下，软件使用费可以被认定为无形资产的一部分。
4. 其他相关费用：在某些情况下，软件使用费也可能被计入其他相关费用。例如，如果软件的使用是为了解决特定的业务问题，那么可以将软件使用费计入其他相关费用。
总的来说，软件使用费计入的会计科目取决于软件的使用性质和企业的实际情况。在实际操作中，企业需要根据具体情况选择合适的会计科目进行核算。同时，企业在进行税务申报时，也需要根据相关规定准确计算和管理软件使用费。
