代理记账公司的软件服务费应由哪方承担责任，这个问题涉及到合同法、公司法以及相关法律规定。以下是对这一问题的详细分析：
1. 合同主体与责任归属：在涉及代理记账公司与委托方（即企业）之间的服务合同中，通常由双方协商确定费用承担方式。如果合同中有明确的条款规定了软件服务费的支付责任，那么应按照该条款执行。如果没有明确约定，则需参考《中华人民共和国合同法》的相关规定。
2. 服务提供者的责任：根据《中华人民共和国合同法》第六十二条的规定，当事人就有关合同内容约定不明确时，应当按照合同的相关条款或者交易习惯来确定。若合同中没有关于软件服务费承担方式的约定，且无法通过其他途径确定，则可能需要考虑服务提供者的责任。
3. 服务接受者的责任：根据《中华人民共和国合同法》第六十三条的规定，当事人履行义务不符合约定时，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。因此，如果代理记账公司未能按合同约定提供服务或提供的服务不符合约定标准，则可能需要承担相应的违约责任，包括支付未完成部分的软件服务费。
4. 第三方因素：在某些情况下，如双方因不可抗力事件无法履行合同，或者一方明确表示不履行合同义务但经催告后仍未履行，可能会考虑适用《中华人民共和国合同法》第九十四条和第九十六条的规定。这些条款允许在特定条件下解除合同或减轻违约方的责任。
5. 法律适用与司法解释：在中国，对于合同纠纷的处理，法院通常会参考《中华人民共和国合同法》、《中华人民共和国公司法》以及其他相关法律法规的规定。此外，最高人民法院发布的司法解释也对合同纠纷的处理提供了指导。
综上所述，代理记账公司的软件服务费应由哪方承担责任，需要综合考虑合同条款、双方的约定、法律规定以及具体情况。在实际操作中，建议双方通过友好协商解决争议，或寻求专业律师的帮助以明确责任归属。
