在讨论软件开发是否全部计入研发费用时，我们需要从多个角度进行分析。首先，我们需要考虑的是研发费用的构成和税务规定。
一、研发费用的构成
1. 直接成本：这包括了软件的设计、开发、测试等直接相关的人力成本，以及与这些活动直接相关的材料、设备和工具的成本。例如，开发人员的工资、办公设备购置费、软件许可费等。
2. 间接成本：这包括了与研发活动间接相关的成本，如管理费用、销售费用、市场推广费用等。这些成本虽然不直接产生于研发活动，但为了支持研发活动的正常进行而发生的。
3. 其他相关费用：这可能包括与研发活动相关的法律咨询费、知识产权申请费、专利申请费等。
二、税务规定
根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，企业的研发费用可以作为税前扣除项，用于计算企业的应纳税所得额。但是，如果企业在计算应纳税所得额时将研发费用全部计入，可能会导致其实际税负低于法律规定的标准。这是因为税法规定的税前扣除标准可能会高于企业实际发生的研发费用。
三、发票问题
1. 发票的必要性：虽然发票是记录和证明交易的一种方式，但在税务申报中，发票并不是必需的。企业可以通过其他方式证明其研发费用的发生，如银行转账记录、合同协议等。
2. 发票的获取：在某些情况下，企业可能无法及时获得发票，尤其是在一些小规模或初创企业中。此外，即使获得了发票，也可能因为某些原因（如发票丢失、损坏）而无法使用。
四、建议
1. 合理归集研发费用：企业应该根据自身的实际情况，合理归集研发费用，确保其能够充分反映企业的实际研发支出。
2. 注意税务规定：企业应当关注税务规定的变化，及时调整其税务策略，确保其符合税法要求。
3. 寻求专业意见：在处理税务问题时，企业可以寻求专业财税顾问的帮助，以确保其税务申报的准确性和合规性。
综上所述，软件开发并不一定全部计入研发费用，而是需要根据具体情况进行合理归集。同时，企业也需要注意税务规定的变化，并寻求专业意见以确保其税务申报的准确性和合规性。
