电子签的扣款合同在法律上是有效力的。根据《中华人民共和国民法典》第四百六十九条，当事人订立合同可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。书面形式是指合同书、信件、电报、电传、传真等能够有形地表现所载内容的形式。以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。因此，只要电子签的扣款合同的内容真实、合法，且符合法律规定的形式要求，就具有法律效力。
办理手续如下：
1. 确定合同主体：合同双方（甲方和乙方）需要明确，确保双方具备签订电子签扣款合同的主体资格。
2. 选择电子签平台：选择一个可靠的电子签平台，如腾讯云、阿里云等，这些平台提供电子签名服务，可以满足合同签署的需求。
3. 准备合同文本：根据合同的性质和内容，准备一份完整的电子合同文本。合同应包括合同双方的基本信息、合同标的、合同金额、付款方式、违约责任等内容。
4. 签订合同：使用选定的电子签平台，按照平台的指引，上传合同文本，进行电子签名。确保电子签名的真实性和合法性。
5. 保存合同：完成电子签名后，将电子合同保存在云端或本地服务器中，确保合同的安全性和可追溯性。
6. 备案登记：根据当地法律法规的要求，可能需要对电子合同进行备案登记。这通常涉及将电子合同提交给相关部门进行审核和登记。
7. 履行合同：合同双方按照合同约定履行各自的义务，确保合同的顺利执行。
8. 纠纷解决：如果发生合同纠纷，可以通过电子签平台提供的纠纷解决机制来处理。例如，一些平台提供了在线仲裁、调解等功能，可以帮助双方快速解决争议。
总之，电子签的扣款合同在法律上有效力，但需要确保合同内容真实、合法，且符合法律规定的形式要求。通过选择合适的电子签平台，准备完整的合同文本，并进行电子签名和备案登记，可以确保合同的顺利执行和纠纷的解决。
