公司注销后，自然人报税系统仍然需要继续报税。
在公司注销过程中，虽然公司这一主体不再存在，但与该公司有直接或间接关联的自然人（如股东、雇员等）的税务义务并不会因此自动解除。根据《中华人民共和国企业所得税法》第五十五条的相关规定，企业应当在年度中间终止经营活动之日起六十日内，向税务机关办理当期企业所得税汇算清缴。这意味着即便公司已经注销，其税务义务仍需得到妥善处理。
此外，尽管公司的税务责任已由清算组承担，但作为公司股东或雇员的自然人，可能仍有未完成或未缴纳的个人所得税或企业所得税。在这种情况下，即使公司已注销，相关个人仍需按照法律规定及时完成税务申报和缴纳。例如，如果一个自然人股东仅从公司获得了500万元的分红，并且没有其他收入，那么他可能不需要缴纳个人所得税；但如果退还的款项超过500万元，则可能需要缴纳个人所得税。
对于自然人来说，了解自身的税务义务和责任是非常重要的。这包括理解哪些收入需要缴纳个人所得税，以及何时需要完成税务申报。同时，了解如何正确处理税务事宜，避免因未能按时报税而产生不必要的财务后果，也是维护自身合法权益的重要环节。
综上所述，虽然公司在注销后不再是法律上的纳税主体，但作为自然人的股东或雇员，仍需按照法律规定继续履行税务义务。这不仅是对法律的遵守，也是确保个人权益不受损失的必要措施。
