POS机（Point of Sale 终端）的费率通常由银行或支付公司设定，不同的银行和支付公司可能会有不同的费率。0.49%的费率可能是指每笔交易的手续费率为0.49%，但这个费率是否适用于1000元的交易取决于具体的银行或支付公司的政策。
假设0.49%的费率适用于1000元的交易，那么手续费计算如下：
手续费 = 交易金额 × 费率
手续费 = 1000元 × 0.49%
手续费 = 1000元 × 0.0049
手续费 = 5元
所以，如果0.49%的费率适用于1000元的交易，那么刷1000元需要支付5元的手续费。但是请注意，这只是一个示例计算，实际的费率可能会有所不同。在实际操作中，你应该咨询你的银行或支付公司以获取准确的费率信息。
