电子合同专用章在法律上具有法律效力。根据《中华人民共和国民法典》的规定，电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力。这意味着，如果电子合同中包含了电子签名或电子印章，那么该合同就具有了法律效力。
然而，需要注意的是，电子合同的法律效力取决于其是否满足法律规定的形式要件。例如，根据《中华人民共和国电子签名法》，电子签名应当符合以下要求：
1. 电子签名制作数据用于电子签名时，属于电子签名人专有；
2. 签署时电子签名制作数据仅由电子签名人控制；
3. 签署后对电子签名的任何改动能够被发现；
4. 签署时或之后对数据电文内容和形式的任何改动能够被发现。
此外，根据《中华人民共和国民法典》的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自双方当事人签字或者盖章时合同成立。因此，如果电子合同中包含了电子签名或电子印章，并且满足了上述法律规定的形式要件，那么该电子合同就具有了法律效力。
