软件公司的主管部门通常是指负责监管和管理软件公司运营的政府部门或机构。这些部门或机构的职责是确保软件公司的经营活动符合相关法律法规、政策和标准，保护消费者权益，维护市场秩序，促进技术创新和发展。
在中国，软件公司的主管部门主要包括以下几个部门：
1. 工业和信息化部（MIIT）：作为国家工业和信息化主管部门，工业和信息化部负责指导和监督全国软件产业的发展，制定相关政策和规划，推动软件与信息服务业的发展。
2. 国家市场监督管理总局（SAMR）：作为国家市场监管部门，国家市场监督管理总局负责监管全国范围内的市场经济活动，包括软件公司的经营活动。它主要通过制定和执行相关法规、政策，加强对软件市场的监管，打击违法违规行为，维护市场秩序。
3. 国家知识产权局（SIPO）：作为国家知识产权管理部门，国家知识产权局负责管理和保护软件相关的知识产权，包括专利、商标、著作权等。它通过加强知识产权保护，鼓励技术创新，促进软件产业的健康发展。
4. 国家互联网信息办公室（CNNC）：作为国家互联网信息管理部门，国家互联网信息办公室负责监管和管理全国范围内的互联网信息内容，包括软件公司的网络产品和服务。它通过加强网络信息安全管理，规范网络信息服务，保障用户权益。
5. 地方各级人民政府及其相关部门：在地方层面，软件公司的主管部门通常是地方政府及其相关部门，如市、县（区）级人民政府及其科技、商务、工商、税务等部门。这些部门负责对本辖区内的软件公司进行日常监管，处理相关事务，提供政策支持和服务。
总之，软件公司的主管部门是国家和地方各级政府及其相关部门，它们通过制定政策、法规和标准，加强对软件公司的监管和管理，促进软件产业的健康发展。
