合作开发软件的著作权归属是一个重要的法律问题，涉及到知识产权的保护以及双方在项目中的贡献和利益分配。根据《中华人民共和国著作权法》的规定，软件著作权归软件开发者所有。这意味着，如果合作开发的软件是由两个或多个开发者共同完成的，那么这些开发者都享有该软件的著作权。
然而，在实际合作开发软件的过程中，可能会出现一些特殊情况，导致著作权的归属不明确或者需要通过法律程序来确定。例如，合作开发的软件中包含了他人的创意、技术或代码，而这些贡献可能无法被完全归因于某一个特定的开发者。在这种情况下，可能需要进行协商或者通过仲裁等方式来解决著作权归属的问题。
此外，合作开发软件还涉及到合同条款的约定。在合作开发软件之前，双方应当签订一份详细的合同，明确约定各自的职责、分工、成果归属以及利益分配等事项。如果合同中没有明确的约定，那么就需要根据法律规定和实际情况来处理著作权的归属问题。
总之，合作开发软件的著作权归属是一个复杂的问题，需要综合考虑各种因素并遵循相关法律法规。在合作开发过程中，建议双方保持沟通和协商，尽量达成一致意见，以避免产生纠纷和不必要的损失。同时，也建议在签订合同时明确约定著作权归属等相关事项，以保障双方的权益和利益。
