开票系统导出来的金额和发票总金额不一样的原因可能有很多，以下是一些可能的原因和解决方案：
1. 输入错误：在录入开票信息时，可能会因为输入数字或文字的错误而导致发票金额与开票系统中的金额不一致。解决方法是仔细核对输入的数据，确保所有信息都正确无误。
2. 计算错误：在进行开票操作时，可能会出现由于计算错误导致的金额不一致。解决方法是重新检查开票过程中的计算过程，确保所有的计算步骤都是正确的。
3. 税率调整：在开具发票时，可能会遇到税率调整的情况，导致发票金额发生变化。解决方法是在开票前确认税率是否正确，并在系统中进行调整。
4. 发票类型不同：如果发票的类型（如增值税专用发票、普通发票等）不同，其金额也会有所不同。解决方法是根据实际需要选择正确的发票类型。
5. 系统问题：可能是开票系统出现了故障或错误，导致导出的金额与实际不符。解决方法是重启开票系统，或者联系系统的技术支持人员进行排查和修复。
6. 银行扣款问题：如果在开票后需要进行银行扣款操作，可能会导致开票系统中的金额与实际银行扣款金额不一致。解决方法是检查银行的扣款情况，确保银行扣款金额正确。
7. 发票校验问题：有时候，开票系统会对发票进行校验，以确保发票的真实性和有效性。如果发票校验失败，可能会导致导出的金额与实际不符。解决方法是按照开票系统的要求，重新提交发票信息进行校验。
8. 发票模板问题：如果使用的发票模板存在问题，也可能导致导出的金额与实际不符。解决方法是更换正确的发票模板，并确保模板中的信息准确无误。
总之，要解决开票系统中导出的金额和发票总金额不一样的问题，需要从多个方面进行排查和解决。首先，仔细核对输入数据，确保所有信息都正确无误；其次，检查计算过程，确保计算步骤正确；然后，根据实际需要选择正确的发票类型；同时，注意系统问题和银行扣款问题；此外，还要确保发票校验和发票模板没有问题。通过综合分析和处理，可以有效地解决开票系统中导出的金额和发票总金额不一样的问题。
