税控系统开具专用发票的流程一般包括以下几个步骤：
1. 准备工作：企业需要确保拥有税控设备，如税控盘或金税盘等，并且已经与税务机关进行了联网。此外，企业还需要准备相关的开票资料，比如增值税发票申请表、购买方信息、货物或服务说明等。
2. 登录税控系统：企业财务人员需要在税控系统中登录自己的账户。通常，税控系统会提供一套用户操作手册供用户参考，包括如何登录和使用系统的各项功能。
3. 填写开票资料：根据开票要求，在税控系统中填写或上传开票资料。这可能包括销售方和购买方的信息、商品或服务的详细信息、价格以及税率等。
4. 审核确认：提交开票资料后，可能需要经过内部审核人员的确认。审核人员会检查提交的资料是否完整、准确，是否符合税务规定。
5. 打印出专用发票：审核通过后，税控系统会生成正式的专用发票。此时，企业可以打印出发票，或者将电子版的发票发送给购买方。
6. 交付发票：将专用发票交给购买方，以便他们进行报销或其他处理。
7. 归档管理：完成以上步骤后，企业应将专用发票和其他相关文件进行归档管理，以备日后查验或核对。
在整个过程中，企业需要注意以下几点：
- 确保所有操作都在税控系统的授权下进行，避免违规操作导致的风险。
- 注意保护税控设备的安全，防止未授权访问。
- 及时更新税控系统软件，以确保能够正常使用最新的功能和数据。
- 遵守税法规定，确保开具的发票符合国家的税收政策。
请注意，具体的操作步骤可能会因地区和企业的具体情况而有所不同，上述步骤仅供参考。如果遇到具体问题，建议咨询当地税务机关或专业的税务顾问。
