小程序协议是否合法，需要从法律角度进行分析。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。在小程序协议中，双方当事人应当遵循自愿、平等的原则，以书面形式订立合同。如果小程序协议的内容不违反法律法规，并且双方当事人的意思表示真实，那么该小程序协议就是合法的。
然而，如果小程序协议的内容涉及到违法事项，或者违反了公序良俗，那么该小程序协议就是无效的。例如，如果小程序协议中约定了一方当事人承担不合理的高额违约金，或者限制了对方当事人的言论自由，那么该小程序协议就可能被认定为无效。此外，如果小程序协议中存在欺诈、胁迫等情形，也可能导致该小程序协议被认定为无效。
总之，小程序协议是否合法需要根据具体的情况来判断。如果小程序协议的内容符合法律法规和公序良俗，且双方当事人的意思表示真实，那么该小程序协议就是合法的。否则，就需要根据具体情况来分析其合法性。
