CDS序列（coding DNA sequence）和cdna（complementary DNA，互补DNA）是理解蛋白质结构差异的两个关键术语。
首先，CDS序列是编码蛋白质的DNA序列，它包含了基因的所有信息，包括起始密码子、终止密码子等。这些信息决定了蛋白质的氨基酸序列，从而决定了蛋白质的结构。因此，CDS序列是研究蛋白质结构和功能的基础。
其次，cdna是DNA复制后的产物，它包含了与CDS序列互补的碱基序列。在复制过程中，cdna会与新的CDS序列进行配对，形成双链DNA。这个配对的过程决定了蛋白质的氨基酸序列，从而决定了蛋白质的结构。因此，cdna也是研究蛋白质结构和功能的重要工具。
通过比较CDS序列和cdna，我们可以了解到蛋白质的结构差异。例如，如果两个蛋白质的氨基酸序列相同，那么它们的CDS序列和cdna也应该是相同的。反之，如果两个蛋白质的氨基酸序列不同，那么它们的CDS序列和cdna也可能不同。这是因为DNA复制过程中可能出现的错误，导致CDS序列和cdna的差异。
此外，我们还可以借助其他技术，如核磁共振、X射线晶体学等，来进一步了解蛋白质的结构。这些技术可以直接观察蛋白质的三维结构，从而更准确地理解蛋白质的功能。
总的来说，CDS序列和cdna是研究蛋白质结构和功能的重要工具，它们帮助我们理解蛋白质之间的差异。通过比较CDS序列和cdna，我们可以了解到蛋白质的结构差异，并通过其他技术进一步了解蛋白质的功能。
