代理记账公司使用的软件通常包括以下几种：
1. 财务管理软件：这类软件主要用于企业的财务管理，包括会计、报表、预算、成本核算等功能。常见的财务管理软件有金蝶、用友、速达等。这些软件可以帮助企业进行日常的财务处理，生成各种财务报表，满足税务申报的需要。
2. 发票管理软件：发票是企业经营活动的重要凭证，代理记账公司需要对客户的发票进行管理和统计。因此，发票管理软件是必不可少的。常见的发票管理软件有百旺金赋、管家婆等。这些软件可以自动识别和录入发票信息，方便企业进行发票管理和审计。
3. 电子发票软件：随着电子商务的发展，电子发票成为企业常用的一种发票形式。代理记账公司需要处理大量的电子发票，因此电子发票软件是必不可少的。常见的电子发票软件有易快报、百望等。这些软件可以实现电子发票的申请、开具、报销等功能，提高企业发票管理的效率。
4. 合同管理软件：代理记账公司需要帮助企业进行合同管理，包括合同的签订、执行、变更、终止等各个环节。因此，合同管理软件是必不可少的。常见的合同管理软件有法大大、合同宝等。这些软件可以帮助企业进行合同的起草、审批、存档等工作，保障合同的合规性和有效性。
5. 客户关系管理（CRM）软件：代理记账公司需要与客户保持良好的沟通，了解客户的需求和反馈。因此，客户关系管理软件是必不可少的。常见的CRM软件有销售易、纷享销客等。这些软件可以帮助企业建立客户档案，跟踪客户信息，提高客户服务质量。
6. 办公自动化软件：除了上述专业的财务软件外，代理记账公司还需要使用办公自动化软件来提高工作效率。常见的办公自动化软件有WPS Office、钉钉等。这些软件可以帮助企业进行文档的编辑、共享、协同工作等，提高工作效率。
总之，代理记账公司使用的软件主要包括财务管理软件、发票管理软件、电子发票软件、合同管理软件、CRM软件以及办公自动化软件。这些软件可以帮助企业实现财务管理、发票管理、合同管理、客户关系管理和办公自动化，提高企业的工作效率和服务质量。
