关于计算机信息系统保密管理暂行规定是否废止的问题，需要从多个角度进行考量。首先，从法律层面来看，该规定是由国家保密局在2004年发布的，旨在规范计算机信息系统的保密管理工作。然而，随着技术的发展和法律法规的更新，原有的规定可能不再适应新的形势。
其次，从实际操作角度来看，计算机信息系统的保密工作涉及到许多方面，如数据安全、网络防护等，这些都需要根据最新的法律法规进行调整和完善。因此，即使原有的规定还在执行，也需要对其进行修订和完善，以适应新的要求。
再者，从技术发展的角度来看，计算机信息系统的保密工作需要不断更新技术和手段，以应对各种新型的安全威胁。这就要求相关部门及时跟进最新的法律法规和技术标准，以确保计算机信息系统的保密工作始终处于领先地位。
综上所述，计算机信息系统保密管理暂行规定已经废止。虽然该规定仍然具有一定的法律效力，但在实际工作中，需要根据最新的法律法规和技术标准进行调整和完善。同时，各部门和单位也应该加强自身的保密意识和能力建设，确保计算机信息系统的安全运行。
